实验室依托完备的本科、硕士、博士人才培养体系，持续培养知农爱农的农业水资源高效利用领域国家急需人才。近五年培养硕博研究生880人、本科生855人。所培养的研究生曾获全国百篇优秀博士学位论文奖1人、提名奖1人，北京市优秀博士学位论文奖1人、提名奖1人。部分毕业生应聘到水利部、农业农村部、中国科学院、中国农业科学院、中国水利水电科学研究院、武汉大学、中国农业大学等政府部门、科研机构或高校工作并成长为业务骨干；近百名学生赴美国、英国、澳大利亚、法国、瑞士、丹麦、以色列等地留学深造。实验室注重创新人才培养模式和方法，“创建‘五链环’野外综合实训平台与‘四融合’人才培养新模式的探索及其实践”获中国学位与研究生教育学会研究生教育成果特等奖，“突出农工交融的农业院校水利工程卓越人才培养体系创建与实践”获国家级教学成果二等奖，康绍忠院士获“全国教书育人楷模”称号，“农业绿色高效用水研究团队”被评为全国教育系统先进集体。